Strukturę organizacyjną i tryb kierowania oraz zadania komórek organizacyjnych określa Regulamin Komendy Rejonowej Policji Warszawa II
1) Kierownictwo
- Komendant Rejonowy Policji Warszawa II
- I Zastępca Komendanta Rejonowego Policji Warszawa II
- Zastępca Komendanta Rejonowego Policji Warszawa II
2) Jednostki Organizacyjne Komendy Rejonowej Policji Warszawa II
Na obszarze działania Komendanta Rejonowego Policji Warszawa II funkcjonują jednostki Policji, których Komendanci (kierownicy jednostek) podlegają Komendantowi Rejonowemu Policji Warszawa II:
- Komisariaty Policji